home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Software Vault: The Sapphire Collection / Software Vault (Sapphire Collection) (Digital Impact).ISO / cdr16 / med9410e.zip / M94B0791.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-11-11  |  3KB  |  44 lines
  1.        Document 0791
  2.  DOCN  M94B0791
  3.  TI    Hyperstabilization of sense-antisense duplexes and inhibition of
  4.        translation (Meeting abstract).
  5.  DT    9412
  6.  AU    Kim DY; Shih DS; Cho DY; Swenson DH; School of Veterinary Medicine,
  7.        Louisiana State University, Baton; Rouge, LA 70803
  8.  SO    Proc Annu Meet Am Assoc Cancer Res; 35:A1835 1994. Unique Identifier :
  9.        AIDSLINE ICDB/94603521
  10.  AB    The antitumor agents CC-1065 and U-71,184 raise the Tm of
  11.        double-stranded DNA. We undertook this study to determine if these
  12.        agents could hyperstabilize RNA-DNA (sense-antisense) duplexes or DNA
  13.        duplexes in which one strand contained phosphorothioate (PS) or
  14.        methylphosphonate (MP) internucleotide linkages. Sequences 1 and 2
  15.        (5'-TTACTTCAGTTATCAGACCA-3'; CC-1065 target underlined) were from the
  16.        env gene of equine infectious anemia virus (EIAV). Seq 1 was DNA and seq
  17.        2 was RNA. Antisense seq 3, 4 and 5 were complementary to seqs 1 and 2
  18.        and were comprised of phosphodiester (PO), PS and MP, resp. Duplexes
  19.        from seq1-seq3, seq1-seq4, seq1-seq5 all bound CC-1065 and showed
  20.        elevations in Tm of 17 to 21 C. Poly(rA)-oligo(dT20) and
  21.        oligo(dA20)-oligo(dT20) showed increases in Tm of 28 and 31 C, resp,
  22.        when bound to CC-1065. Seq2-seq3 and seq2-seq4 each bound 1
  23.        CC-1065/duplex, but insufficient material was available to evaluate Tm.
  24.        U-71,184 caused strong elevation of Tm (greater than 15 C) only with
  25.        seq1-seq5 and oligo(dA20)-oligo(dT20). An mRNA transcript (585-mer) of
  26.        EIAV was targeted approx 200 bases downstream from the initiation site
  27.        with a 20-mer PO antisense oligonucleotide. Translation (wheat germ
  28.        extract) was inhibited in a dose-dependent fashion at antisense:mRNA
  29.        ratios ranging from 10 to 72, and concomitant incubations of the
  30.        duplexes with CC-1065 (4x compared to antisense) caused significant
  31.        enhanced depression of translation for the higher doses. A 20-mer sense
  32.        sequence, incubated with the MRNA, with and without CC-1065, had little
  33.        or no effect on translation. Antisense oligonucleotides tethered to
  34.        CC-1065-like ligands may yield duplexes with MRNA of high stability.
  35.  DE    Base Sequence  *Genes, env  Infectious Anemia Virus, Equine/*GENETICS
  36.        Molecular Sequence Data  Oligodeoxyribonucleotides/*TOXICITY
  37.        Oligonucleotides, Antisense/*TOXICITY  RNA, Messenger/BIOSYNTHESIS
  38.        Transcription, Genetic  Translation, Genetic/*DRUG EFFECTS
  39.        Wheat/METABOLISM  MEETING ABSTRACT
  40.  
  41.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  42.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  43.  
  44.